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电流与波函数的相位有直接的关系，可得约瑟夫森结的电流为
I=Icsinϕ\begin{align} I=I_c sin\phi \end{align} I=Icsinϕ
式中，IcI_cIc为临界电流，相位差为ϕ=ϕ2−ϕ1\phi=\phi_2-\phi_1ϕ=ϕ2−ϕ1。
根据磁矢势A的定义，B磁场将不会改变，如果作如下规范变化
A′=A+∇x\begin{align} A'=A+\nabla x \end{align} A′=A+∇x
在这里，x是任一标量函数，可使两边超导体的波函数相位改变为
ϕ1′=ϕ1−4πehx1ϕ2′=ϕ2−4πehx2\begin{align} \phi_1'=\phi_1-\frac{4\pi e}{h}x_1 \end{align} \begin{align} \phi_2'=\phi_2-\frac{4\pi e}{h}x_2 \end{align} ϕ1′=ϕ1−h4πex1ϕ2′=ϕ2−h4πex2
现在将两点的波函数相位差定义为
ϕ=ϕ2−ϕ1+2πΦ0∫12A⋅dl\begin{align} \phi=\phi_2-\phi_1+\frac{2\pi}{\Phi_0}\int_{1}^{2}A\cdot dl \end{align} ϕ=ϕ2−ϕ1+Φ02π∫12A⋅dl
式中，Φ0=h2e=2.07×\Phi_0=\frac{h}{2e}=2.07\timesΦ0=2eh=2.07× 10-5 Wb，称为单磁通量子，是最小的磁通量单位。
代入（1）式，可得
I=Icsinϕ=Icsin(ϕ2−ϕ1+2πΦ0∫12A⋅dl)\begin{align} I=I_csin\phi=I_csin(\phi_2-\phi_1+\frac{2\pi}{\Phi_0}\int_{1}^{2}A\cdot dl) \end{align} I=Icsinϕ=Icsin(ϕ2−ϕ1+Φ02π∫12A⋅dl)
（6）式表明约瑟夫森结电流不仅与结电压有关，而且与磁场有关，结电压能决定相位差ϕ2−ϕ1\phi_2-\phi_1ϕ2−ϕ1