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JS入口函数指的是JavaScript中的主入口函数，用来初始化页面加载完成后的操作。通常情况下，JS入口函数是在HTML页面中的<script>标签中定义的，通过onload事件等方式触发调用。

jQuery入口函数则是指使用jQuery库时的主入口函数，也就是$(document).ready()函数。它的作用是在DOM树加载完成后执行的函数，用来初始化页面操作。与JS入口函数相比，jQuery入口函数具有以下特点：

1. 简洁语法：使用jQuery库可以简化DOM操作和事件处理等操作，使代码更简洁易读。
2. 跨浏览器支持：jQuery库封装了许多浏览器兼容性的细节，可以更方便地开发跨浏览器的Web应用。
3. 插件支持：jQuery库具有丰富的插件系统，可以通过使用插件来扩展功能。
4. 链式操作：jQuery库支持链式操作，可以在一个选择器中连续使用多个方法。
5. 事件处理：jQuery库提供了便捷的事件处理方法，可以更方便地处理事件。

综上所述，虽然JS入口函数和jQuery入口函数都用于在页面加载完成后初始化操作，但是使用jQuery入口函数可以更简洁、易读，并且拥有更多便捷的功能。因此，在使用jQuery库的情况下，推荐使用jQuery入口函数来进行页面初始化。